分子生物中RNA 和 DNA 提取會常常遇到一些問題,下面小編就RNA 和 DNA 提取實驗中的通常遇到的幾個問題進行解析。
1.提取產(chǎn)量低
如果您遇到的 DNA/RNA 產(chǎn)量低于您對樣品的預期,則需要考慮許多因素。通常,這是一個裂解問題。未裂解是產(chǎn)量低的主要原因。它也可能是由不正確的綁定條件引起的。確保使用新鮮的優(yōu)質(zhì)乙醇(100% 200 標準)稀釋緩沖液或添加到結(jié)合的步驟。劣質(zhì)乙醇或舊庫存可能已經(jīng)吸收了水分,并且濃度不正確。如果洗滌緩沖液制備不正確,您可能正在洗掉提取的 DNA 或 RNA。
2.提取低純度
如果提取的 DNA 被蛋白質(zhì)污染(低 260/280),那么您可能開始時樣品過多,而蛋白質(zhì)沒有去除或溶解。
如果 DNA 的 260/230 比率不佳,則問題通常是結(jié)合或洗滌緩沖液中的鹽分。確保使用最高質(zhì)量的乙醇來制備洗滌緩沖液,如果問題仍然存在,請再次洗滌色譜柱。
與其他樣品相比,一些樣品含有更多的抑制劑。環(huán)境樣品特別容易出現(xiàn)純度問題,因為腐殖質(zhì)在提取過程中會被溶解。
腐殖質(zhì)的行為與 DNA 相似,很難從硅膠柱中去除。
3.DNA或RNA降解
降解是RNA制備中常常到的問題。因為在 RNA 提取過程中,樣品儲存不當或裂解效率低等情況都會導致降解。對于 DNA 提取,降解不是一個大問題,因為對于 PCR,DNA 可以被剪切并且工作正常,如果不希望有較多剪切的 DNA,可以使用弱裂解的方法。
PCR 凈化時的注意事項
PCR 凈化其實并不是 DNA 提取技術(shù)本身,但它是一種效率高且簡單的技術(shù),它只是添加高濃度的結(jié)合鹽(通常每體積 PCR 反應 3-5 體積鹽)和離心來過濾。
在實驗過程中,PCR Clean-up 試劑盒出現(xiàn)故障也會導致整個實驗功虧一簣。
因為在PCR 反應中有較多吸收 260 度紫外線的物質(zhì),比如:核苷酸、去污劑、鹽和引物。所以,PCR 凈化試劑盒經(jīng)常無法正常工作可能是由于 PCR 反應失敗所造一般成較難清理。
蘇州阿爾法生物14年專注于科研儀器、實驗室儀器供應,提供實驗室儀器包括生物反應器、震蕩培養(yǎng)箱、二氧化碳培養(yǎng)箱、瑞寧移液器、熒光定量PCR儀、電泳儀、電泳槽、凝膠成像儀、流式細胞儀、粒徑分析儀等。